Ich vermute, dass es an den Einstellungen der beiden Apps liegt, eine davon wird deutlich öfter Messpunkte setzen, als die andere. Außerdem scheint die mit dem roten Banner eine Art Timeout zu haben (zB wenn Du stehst). Evtl. hat die sehr langsame Bewegungen garnicht gemessen?
Höhenmessung per GPS ist natürlich ungenau, sollte hier aber wenig effekt haben, da ja beide Apps den gleichen Empfänger genutzt haben. Aber Höhenmetermessung als Solche ist schon etwas sehr ungenaues, weil hier eben Deltas aufsummiert werden und da ist immer die Frage, wie genau man das macht (Ist eine Bodenwelle schon 0,1hm ?).